Polüpeptiidide sünteesiks kasutatavate aminohapete toorainete kaitserühmad

20Tavalised aminohapped võib jaotada mitmesse kategooriasse vastavalt nende kõrvalahelatele: alifaatsed aminohapped (Ala, Gly, Val, Leu, Ile), aromaatsed aminohapped (Phe, Tyr, Trp, His), amiid- või karboksüülkülgahela aminohapped (Asp, Glu, Asn, Gln), aluselised kõrvalahela aminohapped (Lys, Ar1} aminohapped) Met), alkoholi-sisaldavad aminohappeid (Ser, Thr), iminohapet (Pro).

Aminohapete kaitse peptiidide keemilises sünteesis on väga kriitiline ja määrab otseselt sünteesi edukuse. Kuna paljudel 20 tavalisest aminohappest on aktiivsed kõrvalahelad ja neid tuleb kaitsta, nõutakse üldiselt, et need kaitserühmad oleksid sünteesiprotsessi ajal stabiilsed, neil ei oleks kõrvalreaktsioone ning neid saaks pärast sünteesi lõppu täielikult ja kvantitatiivselt eemaldada. Sünteesi ajal kaitset vajavate aminohapete hulka kuuluvad: Cys, Asp, Glu, His, Lys, Asn, Gln, Arg, Ser, Thr, Trp, Tyr. Kaitset vajavad rühmad: hüdroksüül, karboksüül, merkapto, amino, amiid, guanidiin, indool, imidasool jne.

Trp-s Seda pole vaja kaitsta, sest indool on looduses suhteliselt stabiilne. Muidugi ei pruugi erilistel asjaoludel mõned aminohapped olla kaitstud, näiteks Asn, Gln , Thr, Tyr.

Aminohapete kõrvalahelate jaoks on palju kaitserühmi. Samal kõrvalahelal on palju erinevaid kaitserühmi, mida saab erinevatel tingimustel valikuliselt eemaldada. Sellel on suur tähtsus tsükliliste peptiidide ja polüpeptiidide modifitseerimisel. Lisaks on külgahela kaitserühm valitud sünteesimeetodiga tihedalt seotud. Vedel faas ja tahke faas on erinevad. Tahkes faasis BOC ja FMOC Strateegiad on samuti erinevad. Teatud mõttes on peptiidide keemia aminohappeid kaitsvate rühmade paindlik kasutamine ja kombineerimine. Seoses külgahela kaitserühmade kasutamisega lugege palun Wang Dexini "Tahkefaasi orgaaniline süntees" – "Põhimõtted ja kasutusjuhend" 4. peatükki, kus tutvustame siin peamiselt Cys, Lys, Asp Mitmeid kaitserühmi ja nende eemaldamise meetodeid. Cys On kolm kõige levinumat kaitserühma: Trt, Acm, Mob, Need kolm kaitserühma võivad viia lõpule mitme disulfiidsideme paariga polüpeptiidide sünteesi.

Lys Kõige levinumad kaitserühmad on: Boc, Fmoc, Trt, Dde, Allüül. See pakub palju ortogonaalseid kaitsestrateegiaid tsükliliste peptiidide tahkefaasis{0}}sünteesiks. Asp Kõige levinumad kaitserühmad on: Otbu, OBzl, OMe, OAll, OFm, Pakutakse ka mitmesuguseid ortogonaalseid kaitsestrateegiaid.
 

lühend	struktuur	Välistamistingimused
Trt		TFA, HCl/HOAc, I2/MeOH
Acm		I2/MeOH, Hg2+
Mob		HF, TFMSA, Hg2+

lühend	struktuur	Välistamistingimused
Trt		TFA, HOAc, HCOOH
Boc		HCl/HOAc, TFA/DCM
Fmoc		Pip/DMF, NaOH/MeOH
Dde		H2NNH2/DMF
Allüül		Pd (Ph3P)4, morfoliin/THF

lühend	struktuur	Välistamistingimused
Otsbu		TFA, HOAc, HCOOH
OBzl		H2/Pd, HF, TFMSA
OMe		NaOH/MeOH
OKõik		Pd(Ph3P)4, morfoliin/THF
OFm		Pip/DMF, DBU/DMF